hsa-miR-1908 靶基因预测及生物信息学分析

杨蕾1,2,季晨博1,2,史春梅1,2 陈玲1,2,庞玲霞1,2,夏黎1,2,郭锡熔1,2,倪毓辉1,2
1. 南京医科大学儿科研究所（江苏南京　210029）；2. 南京医科大学附属南京妇幼保健院儿童保健科（江苏南京　210004）

摘要：　

目的　对hsa-miR-1908进行系统的生物信息学分析，预测其可能参与的生物学过程及信号通路，为深入研究其在人脂肪细胞分化、肥胖发生等过程中的功能与机制奠定基础。

方法　应用miRBase获取hsa-miR-1908的序列，并分析其特征；应用miRanda预测hsa-miR-1908的靶基因，并取预测结果及基因芯片结果的交集，进一步进行基因功能注释（Gene ontology）和生物通路富集分析（Pathway enrichment)。

结果　hsa-miR-1908在各物种之间有一定保守性，其靶基因功能富集于Wnt受体信号的调控、细胞周期、细胞凋亡等生物学过程；其靶基因信号通路富集于促性腺激素释放激素信号通路、MAPK信号通路、胰岛素信号通路、细胞周期等信号转导通路及胰腺癌等疾病通路中。

结论　hsa-miR-1908预测的靶基因集合富集于多个信号通路及生物学过程，与肥胖密切相关，为后续has-miR-1908在人脂肪细胞中生物学功能研究奠定基础。
来源：临床儿科杂志