转自生物通

10月21日，2015年度中国科技论文统计结果在京发布。据统计，2014年，SCI数据库共收录世界科技论文176.63万篇，其中中国科技论文26.35万篇，连续6年排名世界第二位，占世界份额的14.9%。排在第一位的美国，其论文数量为48.66万篇，是我国的1.8倍，占世界份额的27.5%。

生物学类发表SCI论文24891篇，其中农业科学、药学与毒物学等7个领域论文的被引用次数排名世界第2位，环境与生态学和物理学排在世界第3位，生物与生物化学和地学排名世界第5位。

“2005-2015年我国高被引论文中被引次数最高的10篇论文”中，是华大基因2010年发布于Nature杂志上的一篇文章：“A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing ”排列在第一，引用次数为1766。

这篇文章由华大基因王俊与法国国立研究中心合作领导完成，是当期Nature杂志的封面文章，主要公布了人体肠道菌基因组研究成果。这一成果属于MetaHIT项目组，发表了从丹麦和西班牙124位健康的、超重的和肥胖的成年人以及炎症患者提取的人肠道微生物菌落的一个基因目录，所获数据为了解这一基因组（比人类基因组大150倍）提供了第一手资料，并且表明这些基因大部分是在不同个体之间共享的。根据由这些基因所编码的各种不同功能，研究人员就有可能来确定最小的肠道元基因组和最小的肠道细菌基因组。这不仅将对人类自身健康与体内微生物的微妙关系做出科学的诠释，也更有助于预防、监控和干预由肠道菌群引发的肥胖、肠炎和糖尿病等疾病。

另外一篇文章：Characterization of microRNAs in serum: a novel class of biomarkers for diagnosis of cancer and other diseases，则是南京*科院张辰宇教授研究组的成果（引用次数：1217）。

这项研究首次全面描绘了健康受试者和肺癌、结肠直肠癌、糖尿病患者的整个血液miRNA谱，发现人类和其它哺乳动物体内存在稳定水平的血清miRNA，并揭示了肺癌、结肠直肠癌、糖尿病等疾病状态下血清miRNAs的特异表达模式，他们所鉴定的特定的血清miRNA 表达谱可以构成识别癌症与其他疾病的“指纹”。

研究结果表明，血清imRNAs能够作为癌症或其他疾病的生物标记，其重要意义在于创造性地提供了一种非损伤性的癌症诊断手段。虽然肿瘤生物标记的不断发现已大大改善了癌症的诊断，但是目前这些biomarkers的检测大多程序繁琐且具有损伤性从而限制了其临床应用。这一最新研究进展为癌症及其他疾病的诊断提供了一种新的非损伤性的诊断方法并可能带来未来临床医学上的变革。

另外，据统计称，中国在高影响力期刊（被引次数超过10万次且影响因子超过30的国际期刊：Nature、 Science、Cell、Chem Rev、New Engl J Med、Lancet、JAMA-J AM MED ASSOC）上发表的论文中有3060篇是受国家自然科学基金资助产出的，占55.6%。发表在世界各学科高影响力期刊上的论文较多的高校是：北京大学（210）、清华大学（209）、上海交通大学（181）、浙江大学（180）、哈尔滨工业大学（156）。

生物类论文选介：

论文题目：Inflammatory caspases are innate immune receptors for intracellular LPS

第一作者：Shi, Jianjin

所属机构：北京大学

来源期刊：NATURE.2014,514（7521）：187-+

被引次数：43

这篇文章是邵峰实验室的成果，邵峰实验室近年来一直专注于研究宿主细胞质中感知细菌和病原细菌的分子免疫机制。在2011年的一项研究中，他们首次鉴定出NAIP家族的PRR蛋白不仅可以作为受体直接识别细菌鞭毛素蛋白，也可以识别存在于一大类致病菌中的毒力因子分泌系统的组成蛋白（Zhao et al., Nature 2011）。在今年上半年的研究中，邵峰团队还发现Pyrin蛋白（遗传突变导致家族性地中海热自炎症疾病）作为PRR蛋白感受多种不同病原菌和毒素对宿主Rho家族小G蛋白的修饰和失活，进而介导巨噬细胞炎症小体复合物的*和下游炎性蛋白酶caspase-1的激活，启动抗细菌炎症反应（Xu et al., Nature 2014）。在这项最新的研究中，他们发现人和小鼠的炎症性Caspase-4/5/11为胞内LPS的受体，直接结合LPS发生寡聚化而被激活，导致细胞炎症性坏死。

在该项研究中，邵峰实验室的研究人员首先建立了一个可以将LPS高效导入哺乳动物细胞内的转染方法，使得LPS诱导细胞坏死由此前报道的20~30%提升到95%左右，利用这个强大和稳定的实验体系，他们首先发现人源的单细胞对胞内LPS诱导细胞坏死敏感，该过程由Caspase-4蛋白所介导。Caspase-4以及Caspase-5为小鼠非经典炎症小体通路中Caspase-11在人细胞中的同源蛋白，都属于炎症性Caspase家族。他们同时也发现，和小鼠Caspase-11只在巨噬细胞中表达不一样，Caspase-4表达并不局限于巨噬细胞和单细胞，在一些人的上皮细胞和角质细胞中也有很高的表达，并且这些非免疫细胞也能通过Caspase-4响应胞内LPS，发生严重的细胞坏死。另外，他们的研究也表明Caspase-5和Caspase-4功能类似。

论文题目：Epidemiology of Human Infections with Avian Influenza A（H7N9） Virus in|China

第一作者：Li, Qun

所属机构：公共卫生急救中心

来源期刊：NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE.2014,370（6）：520-532

被引次数：133

这篇文章介绍了禽流感A（H7N9）病毒在中国人感染的流行病学。

研究人员对每例H7N9病毒感染的确诊病例进行现场研究。如借助于实时逆转录-聚合酶链反应检测（RT-PCR），病毒分离，或血清学检验验证H7N9病毒的存在患者被认为是确诊病例。从确诊患者得到人口统计学指标特征，暴露史，和疾病时间表资料。密切接触者监视疾病症状7天。从有症状的密切接接触者取得咽喉拭子和借助于实时RT-PCR检验是否存在H7N9病毒。

结果表明有确诊H7N9病毒感染的大多数人有严重下呼吸道疾病，是流行病学史不相关的，有最近暴露至家禽史。但是，四个家庭不能除外有限的，非持续性人-至-人H7N9病毒传播。

论文题目：The STAT3-Binding Long Noncoding RNA lnc-DC Controls Human Dendritic|Cell Differentiation

第一作者：Wang, Pin

所属机构：第二军医大学，医学免疫学国家重点实验室

来源期刊：SCIENCE.2014,344（6181）：310-313

被引次数：38

这篇是曹雪涛院士研究组的成果，主要发现一种选择性表达于人树突状细胞中的长链非编码核糖核酸（lncRNA），通过与细胞浆内信号转导蛋白分子直接作用的新方式调控了树突状细胞分化发育与抗原提呈功能。

课题组用基因芯片和深度测序技术，分析了lncRNA在人体外周血单核细胞分化为非成熟、成熟DC过程中的表达谱变化，首次发现了一个选择性存在于人体DC的lncRNA，并将这尚未知道功能的新lncRNA命名为“树突状细胞长链非编码RNA”（lnc-DC）。研究发现，存在于DC细胞浆中的lnc-DC，能够通过直接结合信号转导蛋白分子并调控其*化，发挥其维持与促进人体DC激活免疫应答的能力。

论文题目：Fluorine in Pharmaceutical Industry: Fluorine-Containing Drugs|Introduced to the Market in the Last Decade （2001-2011）

第一作者：Wang, Jiang

所属机构：中国科学院，上海药物所

来源期刊：CHEMICAL REVIEWS.2014,114（4）：2432-2506

被引次数：180

论文题目：High-throughput screening of a CRISPR/Cas9 library for functional|genomics in human cells

第一作者：Zhou, Yuexin

所属机构：北京大学，蛋白质工程及植物基因工程国家重点实验室

来源期刊：NATURE.2014,509（7501）：487-+

被引次数：45

论文题目：Mixed Lineage Kinase Domain-like Protein MLKL Causes Necrotic Membrane|Disruption upon Phosphorylation by RIP3

第一作者：Wang, Huayi

所属机构：北京生命科学研究所

来源期刊：MOLECULAR CELL.2014,54（1）：133-146

被引次数：49

论文题目：Afatinib versus cisplatin plus gemcitabine for first-line treatment of|Asian patients with advanced non-small-cell lung cancer harbouring EGFR|mutations （LUX-Lung 6）： an open-label, randomised phase 3 trial

第一作者：Wu, Yi-Long

所属机构：广东省肺癌研究所，广东省人民医院

来源期刊：LANCET ONCOLOGY.2014,15（2）：213-222

被引次数：87

论文题目：Health benefits of qigong or tai chi for cancer patients: a systematic|review and meta-analyses

第一作者：Zeng, Yingchun

所属机构：广州医学院第三附属医院

来源期刊：COMPLEMENTARY THERAPIES IN MEDICINE.2014,22（1）：173-186

被引次数：11

论文题目：Combining evolutionary information extracted from frequency profiles|with sequence-based kernels for protein remote homology detection

第一作者：Liu, Bin

所属机构：哈尔滨工业大学

来源期刊：BIOINFORMATICS.2014,30（4）：472-479

被引次数：46

论文题目：Clinical and epidemiological characteristics of a fatal case of avian|influenza A H10N8 virus infection : a descriptive study

第一作者：Chen, HaiYing

所属机构：南昌市疾控中心

来源期刊：LANCET.2014,383（9918）：714-721

被引次数：74

论文题目：A review of soil heavy metal pollution from mines in China: Pollution|and health risk assessment

第一作者：Li, Zhiyuan

所属机构：南京大学

来源期刊：SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT.2014,468:843-853

被引次数：40

论文题目：Three-dimensional structure of human gamma-secretase

第一作者：Lu, Peilong

所属机构：清华大学，蛋白质科学教育部重点实验室

来源期刊：NATURE.2014,512（7513）：166-+

被引次数：37

论文题目：Activating hotspot L205R mutation in PRKACA and adrenal Cushing's|syndrome

第一作者：Cao, Yanan

所属机构：上海交通大学医学院附属瑞金医院

来源期刊：SCIENCE.2014,344（6186）：913-917

被引次数：28

论文题目：Whole-genome sequencing of cultivated and wild peppers provides insights|i* Capsicum domestication and specialization

第一作者：Qin, Cheng

所属机构：四川农业大学

来源期刊：PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF|AMERICA.2014,111（14）：5135-5140

被引次数：15

论文题目：Advances in paper-based point-of-care diagnostics

第一作者：Hu, Jie

所属机构：西安交通大学，生物医学信息工程教育部重点实验室

来源期刊：BIOSENSORS & BIOELECTRONICS.2014,54:585-597

被引次数：43

论文题目：Comprehensive Review in Current Developments of Imidazole-Based|Medicinal Chemistry

第一作者：Zhang, Ling

所属机构：西南大学

来源期刊：MEDICINAL RESEARCH REVIEWS.2014,34（2）：340-437

被引次数：28

论文题目：Translocation of mixed lineage kinase domain-like protein to plasma|membrane leads to necrotic cell death

第一作者：Chen, Xin

所属机构：厦门大学，细胞应激生物学国家重点实验室

来源期刊：CELL RESEARCH.2014,24（1）：105-121

被引次数：49

论文题目：Hand, foot, and mouth disease in China, 2008-12: an epidemiological|study

第一作者：Xing, Weijia

所属机构：中国疾控中心

来源期刊：LANCET INFECTIOUS DISEASES.2014,14（4）：308-318

被引次数：32

论文题目：Effect of closure of live poultry markets on poultry-to-person|transmission of avian influenza A H7N9 virus: an ecological study

第一作者：Yu, Hongjie

所属机构：中国疾控中心

来源期刊：LANCET.2014,383（9916）：541-548

被引次数：49

论文题目：Regulation of Drought Tolerance by the F-Box Protein MAX2 in|Arabidopsis（1[C][W][OPEN]）

第一作者：Bu, Qingyun

所属机构：中国科学院，东北地理农经所

来源期刊：PLANT PHYSIOLOGY.2014,164（1）：424-439

被引次数：12

论文题目：Programming and Inheritance of Parental DNA Methylomes in Mammals

第一作者：Wang, Lu

所属机构：中国科学院，基因组科学及信息重点实验室

来源期刊：CELL.2014,157（4）：979-991

被引次数：37

论文题目：The locust genome provides insight i* swarm formation and|long-distance flight

第一作者：Wang, Xianhui

所属机构：中国科学院动物研究所

来源期刊：NATURE COMMUNICATIONS.2014,5:1-9

被引次数：26

论文题目：Generation of Gene-Modified Cynomolgus Monkey via Cas9/RNA-Mediated Gene|Targeting in One-Cell Embryos

第一作者：Niu, Yuyu

所属机构：中国科学院昆明植物所

来源期刊：CELL.2014,156（4）：836-843

被引次数：97

论文题目：Cryo-EM Study of the Chromatin Fiber Reveals a Double Helix Twisted by|Tetranucleosomal Units

第一作者：Song, Feng

所属机构：中国科学院生物物理所

来源期刊：SCIENCE.2014,344（6182）：376-380

被引次数：34

论文题目：Mitoflash frequency in early adulthood predicts lifespan in|Caenorhabditis elegans

第一作者：Shen, En-Zhi

所属机构：中国农业大学

来源期刊：NATURE.2014,508（7494）：128-+

被引次数：16

论文题目：Hyperspectral canopy sensing of paddy rice aboveground biomass at|different growth stages

第一作者：Gnyp, Martin L.

所属机构：中国农业大学

来源期刊：FIELD CROPS RESEARCH.2014,155:42-55

被引次数：11

论文题目：The Brassica oleracea genome reveals the asymmetrical evolution of|polyploid genomes

第一作者：Liu, Shengyi

所属机构：中国农业科学院，油料作物研究所

来源期刊：NATURE COMMUNICATIONS.2014,5:-

被引次数：31

论文题目：Whole-genome sequence of a flatfish provides insights i* ZW sex|chromosome evolution and adaptation to a benthic lifestyle

第一作者：Chen, Songlin

所属机构：中国水产科学院，黄海水产研究所

来源期刊：NATURE GENETICS.2014,46（3）：253-+

被引次数：45

论文题目：Annual report on status of cancer in China, 2010

第一作者：Chen, Wanqing

所属机构：中国医学科学院肿瘤研究所

来源期刊：CHINESE JOURNAL OF CANCER RESEARCH.2014,26（1）：48-58

被引次数：40

论文题目：A Prospective, Molecular Epidemiology Study of EGFR Mutations in Asian|Patients with Advanced Non-Small-Cell Lung Cancer of Adenocarcinoma|Histology （PIONEER）

第一作者：Shi, Yuankai

所属机构：中国医学科学院肿瘤研究所

来源期刊：JOURNAL OF THORACIC ONCOLOGY.2014,9（2）：154-162

被引次数：41

论文题目：starBase v2.0: decoding miRNA-ceRNA, miRNA-ncRNA and protein-RNA|interaction networks from large-scale CLIP-Seq data

第一作者：Li, Jun-Hao

所属机构：中山大学

来源期刊：NUCLEIC ACIDS RESEARCH.2014,42（D1）：D92-D97

被引次数：61